截至2024年，长崎县至少有一所国立大学、一所公立大学和多所私立大学。

国立大学

长崎大学

地址：长崎县长崎市文教町

特色：日本著名一流研究型国立大学之一，由长崎医科大学等六所大学合并而成，拥有医学部等著名学科。

公立大学

长崎县立大学

特色：由长崎县政府和财团设立，是日本公立制大学中历史悠久的高等学府之一，以信息媒体学和营养看护学专业著称。

私立大学

活水女子大学

长崎卫斯理公会大学

长崎外国语大学

长崎国际大学

长崎纯心大学

长崎综合科学大学

长崎玉成短期大学

长崎女子短期大学

长崎短期大学。

建议：

长崎大学是日本著名的国立大学，拥有强大的医学专业，特别推荐对医学感兴趣的学生。

长崎县立大学在信息媒体学和营养看护学专业方面有较高的声誉，适合希望在这些领域发展的学生。

长崎玉成短期大学等私立大学则提供了多样化的学科选择，适合希望在不同领域学习的学生。