建邺区位于南京市，拥有多所知名大学，其中包括：

南京大学- 历史悠久、声誉卓著的综合性大学，拥有优秀的师资力量和丰富的科研资源。

南京理工大学- 以工科闻名，是国家“211工程”和“985工程”重点建设的高水平大学。

南京航空航天大学- 中国航空航天领域著名的学府，培养了大量科技人才。

东南大学- 综合性研究型大学，拥有强大的理工科学研究能力。

南京工程学院- 南京市重点支持的高校之一，致力于培养高素质的工程技术人才。

南京广播电视大学

江苏师范大学南京分校

江苏海事职业技术学院

南京特殊教育职业技术学院（南京特殊教育师范学院始建于1982年，前身是教育部创办的中国第一所特殊教育师范学校，学校自1997年开始培养五年制大专生，2002年升格为普通高等学校）

南京市职工大学

南京高等职业技术学校

这些大学在建邺区提供了丰富的教育资源和研究设施，是该地区高等教育的重要组成部分。